De 16h 30 à 18h : une permanence est assurée par un personnel restreint composé d’un biologiste, d’une secrétaire et d’une technicienne. Ils réalisent les examens urgents de tous les secteurs. Le biologiste de permanence assure l’astreinte opérationnelle de la nuit qui suit de 18h00 à 08h00 le lendemain, sauf cas particuliers.

En semaine, de 18h00 à 8h00 le lendemain matin : une astreinte opérationnelle est assurée par un biologiste ayant une compétence pour le diagnostic du paludisme. Un tableau de garde trimestriel est organisé par le chef de service.

Le samedi matin : le laboratoire est ouvert de 8h00 à 12h00. Le personnel de permanence est composé d'un seul biologiste, et de deux techniciens. En mycologie, l’activité diagnostique habituelle est assurée, tandis qu’en parasitologie elle se limite aux examens directs et aux urgences (paludisme, pneumocystose, amibiase). Il n’y a pas d’examens sérologiques, ni de biologie moléculaire.

Samedi après-midi, dimanches et jours fériés : ces périodes sont couvertes par une garde et une astreinte opérationnelle. La garde au laboratoire est assurée par un interne, le samedi après-midi de 17h00 à 18h00 et le dimanche et les jours fériés en demi garde du matin de 8h00 à 12h00. Cette garde et cette astreinte n’assurent que les examens urgents en parasitologie, l’ensemencement des produits en mycologie, la maintenance des automates d’hémocultures et les réponses des hémocultures positives. Les résultats urgents sont téléphonés. Les réponses écrites sont éditées le premier jour ouvrable suivant.

La garde et l’astreinte opérationnelle du week-end sont assurées par un biologiste ayant la compétence pour le diagnostic du paludisme. L’interne de garde a aussi pour rôle d’assurer une double lecture des examens urgents dans les 24 heures qui suivent le premier examen.