Ce laboratoire a pour vocation de diagnostiquer les infections parasitaires et fongiques humaines mais également animales. Il est constitué de trois entités, un laboratoire de la toxoplasmose adossé à un centre nationale de référence (pôle immunologie et laboratoire associé pour le pôle biologie moléculaire), un laboratoire de parasitologie et un laboratoire de mycologie. Le laboratoire de la toxoplasmose possède essentiellement une activité d’expertise pour les laboratoires d’analyses médicales privées et pour les CHG régionaux, le laboratoire de parasitologie possède une activité se tournant vers le diagnostic des infections d’origine tropicales dont le paludisme tandis que le laboratoire de mycologie se destine au diagnostic des infections nosocomiales et opportunistes. Il dispose également de compétences pour l’identification d’insectes et d’acariens parasites. La liste des analyses se trouve sur le site des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg.

Le laboratoire s’est intégré dans le nouveau plateau technique de microbiologie qui a ouvert ses portes en octobre 2010. Il regroupe 4 laboratoires : bactériologie, hygiène, parasitologie-mycologie et virologie. Il compte 100 techniciens et secrétaires et 30 biologistes. Voir plus d'informations sur le plateau technique de microbiologie

Les biologistes permanents sont au nombre de 7 auquel il faut adjoindre 4 biologistes contractuels. Le laboratoire assure une garde de 24h/24h pour le diagnostic du paludisme en cas de fièvre au retour des tropiques. Depuis 1995 l'activité n'a cessé de croître, le nombre de B est passé de 5 211 345 B à plus 7 500 000 B en 2010 et in fine 8 480 000 B en 2011 tout en améliorant les performances économiques. Le coût du B sur la base ENCC est ainsi passé de 0,27€/B  en 2007 à 0,23€ /B en 2010. Le coût complet qui prend en compte tous les moyens mis en œuvre par l’établissement pour produire l’activité (y compris les moyens logistiques, les coûts de gestion générale de l’établissement, le coût des bâtiments, les taxes) serait de 0,27€ / B ce qui en fait un laboratoire « rentable ».

Le plateau technique est divisé en 3 UF de production assurant des analyses médicales : immunologie, culture et biologie moléculaire. La signature des résultats est assurée par un seul biologiste présent pour chaque secteur spécifique à notre discipline: Parasitologie, Mycologie et Toxoplasmose. Dans ce cas un biologiste senior contresigne le résultat. Un tableau des signataires est complété mensuellement au plus tard au 25 du mois précédent, est mis à la disposition des techniciennes et des secrétaires et est affiché dans le couloir et les secteurs.

De 16h 30 à 18h : une permanence est assurée par un personnel restreint composé d’un biologiste, d’une secrétaire et d’une technicienne. Ils réalisent les examens urgents de tous les secteurs. Le biologiste de permanence assure l’astreinte opérationnelle de la nuit qui suit de 18h00 à 08h00 le lendemain, sauf cas particuliers.

En semaine, de 18h00 à 8h00 le lendemain matin : une astreinte opérationnelle est assurée par un biologiste ayant une compétence pour le diagnostic du paludisme. Un tableau de garde trimestriel est organisé par le chef de service.

Le samedi matin : le laboratoire est ouvert de 8h00 à 12h00. Le personnel de permanence est composé d'un seul biologiste, et de deux techniciens. En mycologie, l’activité diagnostique habituelle est assurée, tandis qu’en parasitologie elle se limite aux examens directs et aux urgences (paludisme, pneumocystose, amibiase). Il n’y a pas d’examens sérologiques, ni de biologie moléculaire.

Samedi après-midi, dimanches et jours fériés : ces périodes sont couvertes par une garde et une astreinte opérationnelle. La garde au laboratoire est assurée par un interne, le samedi après-midi de 17h00 à 18h00 et le dimanche et les jours fériés en demi garde du matin de 8h00 à 12h00. Cette garde et cette astreinte n’assurent que les examens urgents en parasitologie, l’ensemencement des produits en mycologie, la maintenance des automates d’hémocultures et les réponses des hémocultures positives. Les résultats urgents sont téléphonés. Les réponses écrites sont éditées le premier jour ouvrable suivant.

La garde et l’astreinte opérationnelle du week-end sont assurées par un biologiste ayant la compétence pour le diagnostic du paludisme. L’interne de garde a aussi pour rôle d’assurer une double lecture des examens urgents dans les 24 heures qui suivent le premier examen.